历史沿革：
呼吸内科成立于1980年，先后于1990年、1996年批准成为硕士、博士学位授权学科。
科室状况：
呼吸内科现开展床位45张，其中呼吸重症监护病房床位6张，附设有呼吸内镜室、肺功能室。
教学培养：
承担第二军医大学临床医学院本科生以及硕士和博士研究生的呼吸病学教学工作。
医疗特色：
呼吸内科自成立以来，逐渐形成以肺癌、哮喘、慢性阻塞性肺疾病、肺部感染性疾病、胸膜疾病、呼吸系统的疑难疾病等诊治为主的学科特色，开展了经支气管镜高频电刀、氩气刀、球囊扩张、支架植入等气道腔内介入治疗技术，缓解由肿瘤、感染、创伤等因素导致的气道狭窄对患者造成的痛苦；开展了单孔微创胸腔镜诊治技术，使“不明原因”胸腔积液的大量患者获得了及时、正确的诊断和治疗。
呼吸内科现为全军肺癌微创介入诊疗中心所在单位，中华医学会上海呼吸分会副主任委员、全军呼吸专业委员会副主任委员所在单位。拥有一个优秀的医疗、科研和教学团队，现有主任医师/教授3人，副主任医师/副教授6人，主治医师2人，住院医师3人，技术人员3人，护理人员20人，其中获医学博士学位者8人，硕士学位者2人。近年科室人员有4人次分别入选学校5511人才建设梯队、上海市科技启明星计划、上海市卫生系统优秀青年人才计划。目前科室有博士生导师2人，硕士生导师7人，培养博士及硕士研究生30余名。
近5年来，呼吸内科获得国家科技部“重大新药创制”科技重大专项“十一五”、“十二五”课题各1项，国家自然科学基金8项，省部级基金10项，总金额2300余万元；在国内外著名医学期刊发表论文100余篇，其中SCI收录论著30余篇，影响因子累计70余分；主编专著2部，参编著作10余部。研究成果先后获军队科技进步二等奖5项、三等奖4项，上海市科技进步奖三等奖1项。